AEGH2023

DIAGNOSTICO DE ENFERMEDADES MINORITARIAS: IMPLEMENTACIÓN DE LA PCR-DIGITAL (DDPCR) EN EL ESTUDIO DE MOSAICISMO Y VARIANTES DE BAJA FRECUENCIA. Back
Poster Nº: P0008
Autores: Jordi Genovés; Eloi Piniella; Daniel Castillo; Erik Prados; Andrea Chicharro; Loreto Martorell Sampol
Area: 12. Nuevas aproximaciones y tecnologías diagnósticas
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

El gran avance en el campo de la genética humana con la incorporación de tecnologías como NGS y CGH-Arrays, ha permitido la detección de un gran número de alteraciones genéticas (SNVs,  CNVs) en un solo análisis, facilitando el diagnóstico de enfermedades minoritarias. Al mismo tiempo, se han reportado un número mayor del esperado de mosaicismos, tanto somáticos como germinales, los cuales tienen significativas implicaciones en el fenotipo del paciente. Los mosaicismos de baja frecuencia se han postulado como una de las causas que explicarían una gran proporción de pacientes genéticamente no diagnosticados. Los estudios posteriores de segregación familiar, también han detectado progenitores mosaicos de variantes de patologías consideradas de novo, hallazgos que tienen importantes implicaciones a nivel de asesoramiento genético en las familias.

El objetivo del estudio es: a) Validar el uso de la  ddPCR como técnica para  el estudio de variantes de baja frecuencia, la detección y confirmación de mosaicismos, (SNVs, CNV) y b) Su implementación en la rutina diagnóstica.

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

PCR-digital para validar variantes de baja frecuencia detectadas con cualquier técnica: NGS, Array, Cariotipo, FISH, MLPA, Seq.Sanger. Comparativa de 2 sistemas PCR-digital: a) BioRad QX200 ddPCR System y b) AppliedBiosystems QuantStudio AbsoluteQ digital-PCR System.

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

Hasta el momento se han analizado 29 variantes: 18 SNVs y 11 CNVs. Se detallarán cada uno de los resultados obtenidos, con mediciones de %, reportando detección de falsos negativos y falsos positivos.

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

La implementación de la ddPCR en la rutina diagnóstica para el estudio de CNVs y SNVs de baja frecuencia o mosaicos, ha demostrado tener  un coste beneficio óptimos, y  facilita el diagnóstico en el paciente y el correcto asesoramiento de las familias.