AEGH2023

CARACTERIZACIÓN DE LA RESPUESTA EPIGENÓMICA DEL EPITELIO RESPIRATORIO FRENTE AL TRATAMIENTO CON SALBUTAMOL Back
Poster Nº: P0073
Autores: Javier Pérez García; Maria Pino-yanes; Elizabeth G. Plender; Jamie L. Everman; Celeste Eng; Nathan D. Jackson; Camille M. Moore; Kenneth B. Beckman; Vivian Medina; Obese Asthma Study Group; José Rodríguez Santana; Jesús Villar; Elad Ziv; Max A. Seibold; Esteban G. Burchard
Area: 15. Genómica funcional y epigenómica
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

El salbutamol es el principal broncodilatador empleado en el asma, pero su impacto sobre el epigenoma respiratorio es desconocido. El objetivo de este estudio fue caracterizar los cambios en la metilación del ADN (mADN) inducidos por salbutamol en epitelio respiratorio y evaluar sus implicaciones funcionales.

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

La mADN se evaluó empleando la micromatriz Infinium MethylationEPIC (Illumina) en cultivos celulares del epitelio respiratorio de 97 individuos sometidos a ensayos in vitro de exposición a salbutamol en los que se realizó un estudio de epigenoma completo (EWAS). Los modelos fueron corregidos por heterogeneidad celular y ascendencia genética, y se realizaron ajustes por comparaciones múltiples (p<9x10-8). Los resultados fueron validados en muestras nasales y bronquiales de 10 individuos independientes. Además, se realizaron análisis regionales de metilación diferencial, análisis de sensibilidad y enriquecimiento y análisis del locus del rasgo cuantitativo (QTL) empleando datos de secuenciación de genomas completos y RNA-seq.

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

Se identificaron 22 CpGs y 9 regiones diferencialmente metiladas asociadas con la exposición a salbutamol en epitelio nasal a nivel genómico. Las CpGs cg23032799 (CREB3L1), cg00483640 (MYLK4-LINC01600) y cg05673431 (KSR1) fueron validadas en muestras independientes (tasa de falsos descubrimientos [FDR]<0.05) y no demostraron asociación con el estatus y gravedad del asma. Se identificaron tres variantes genéticas independientes asociadas con los niveles de mADN de estas tres CpGs, así como un impacto de las CpGs cg10290200 (FLNC) y cg05673431 (KSR1) sobre la expresión génica (FDR<0.05). El efecto de la CpG cg23032799 (CREB3L1) fue validado en epitelio bronquial (p=0.030) y asociado con la respuesta broncodilatadora (p=0.004). Finalmente, se observó un enriquecimiento en genes implicados en las rutas de señalización de IL-2, TNF-α y NF-κB (FDR<0.05).

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

Este estudio reveló la existencia de modificaciones en la mADN inducidas por salbutamol en el epitelio respiratorio potencialmente implicadas en rutas biológicas relacionadas con el asma.