Los híbridos CYP2D6 no son funcionales, interfieren en el proceso de genotipado y en la definición del fenotipo farmacogenético, afectando negativamente a predicción de la respuesta de fármacos. El objetivo de este trabajo es caracterizarlos en una población europea-ibérica, y determinar la relevancia clínica de la aproximación analítica empleada para detectarlos.

Se genotipo una cohorte de 271 participantes por CYP2D6*2,*3,*4,*5,*6,*7,*8,*9,*10,*12,*14,*15,*17,*19,*29,*41,*56 y *59 (OpenArray, ThermoFisher). La técnica de referencia para la caracterización estructural (R) implicó ddPCR en un instrumento QX200 (Bio-Rad), tres ensayos de variación en el número de copias (CNV) en la región 5’ del gen, intrón 6 y exón 9; y la confirmación de híbridos y del alelo duplicado en caso de heterocigosis con tres copias mediante XL-PCR. La primera metodología alternativa (MA1) consistió en un único ensayo de CNV en el exón 9 mediante PCR a tiempo real (qPCR) en un termociclador QuantStudio 12k Flex; en la segunda (MA2), se añadió un segundo ensayo de CNV en el intrón 2.

Se observó híbridos en dieciséis participantes (5.6%), catorce de ellos de tipo CYP2D6-CYP2D7 (doce *68+*4 y dos *4.013+*4) y dos de ellos CYP2D7-CYP2D6 (*9/*13+*1 y *2/*13+*2). La estrategia MA1 no detectó ningún híbrido CYP2D7-CYP2D6 y la estrategia MA2 solo uno, produciéndose un error en la inferencia del fenotipo. MA1 no detectó ningún híbrido CYP2D6-CYP2D7, sin afectar al fenotipo farmacogenético. Detectar qué alelo estaba duplicado permitió resolver tres fenotipos: *2x2/*15, normal, *2x2/*17, ultrarrápido, y *2x2/*4, normal, que presentaron fenotipos ambiguos con MA1/MA2.

Debe priorizarse la detección de híbridos de CYP2D6 por su prevalencia y relevancia. El empleo de ensayos CNV requiere, como mínimo, dos ensayos que flanqueen el gen (región 5’ y exón 9); el empleo de un único CNV y el flanqueo incompleto del gen (por ejemplo, intrón 2-exón 9) son aproximaciones analíticas inferiores.