La secuenciación masiva se ha convertido en una herramienta esencial para el diagnóstico clínico, sin embargo, la aplicación clínica del estudio del exoma (WES) sigue siendo más limitada en cuanto a coste y volumen de datos. Los paneles genéticos personalizados (PGP) permiten enriquecer regiones específicas relevantes de una patología no cubiertas en un WES de una manera más rentable y rápida, pero se limitan a un conjunto definido de dianas cuya influencia en la patología debe ser previamente conocida.

En este estudio hemos realizado una evaluación comparativa de los resultados con PGP y WES en la rutina diagnóstica de un hospital terciario para determinar la utilidad potencial de los PGP en el ámbito asistencial.

Hemos analizado datos de WES y 17 PGP de patologías genéticamente heterogéneas, validados y utilizados en rutina diagnóstica. El diseño de los PGP se llevó a cabo determinando las coordenadas genómicas que permitieran una captura óptima de las regiones de interés clínico en cada patología. Para la evaluación comparativa del abordaje en PGP frente al WES, se ha analizado y caracterizado cada aproximación mediante métricas de calidad y de representatividad en ventana virtual.

El porcentaje de bases no cubiertas por WES con respecto a PGP varía entre el 2.45% hasta el 82.4%, determinado por la finalidad de cada diseño, puesto que permite identificar alteraciones ubicadas en regiones no incluidas en WES como son elementos reguladores, regiones intrónicas (variantes puntuales o determinación de traslocaciones), así como otras regiones o entidades no codificantes.

Un buen y actualizado diseño de PGP contribuye a optimizar el abordaje diagnóstico para caracterizar aquellas variantes que una aproximación WES no puede cubrir. Además suponen una ventaja en coste, profundidad de secuenciación y rapidez analítica que debe ser considerado frente al beneficio clínico de poder estudiar el exoma en su totalidad.