La arquitectura y la dinámica de las poblaciones de células T están estrechamente relacionadas con la respuesta inmune celular al SARS-Cov2. En este estudio, caracterizamos el repertorio de receptores de células T mediante secuenciación y análisis bioinformático (TCRseq) para identificar cambios clave asociados con la gravedad de COVID-19.

Se recogieron muestras de sangre de 175 pacientes COVID-19 con postinfección confirmada. La región 3 determinante de la complementariedad de la cadena TCRβ (CDR3) se detectó y amplificó mediante el kit “AmpliSeq for Illumina Immune Repertoire Plus, TCR beta panel” (Illumina) y se secuenció mediante NGS (paired-end, 150pb x2) en el Nextseq 500 (Illumina). Para medir el repertorio, la riqueza, la diversidad, la clonalidad y las métricas de uso alélico V(D)J, se llevó a cabo el análisis bioinformático de 173 muestras mediante “MIXCR App”.

Los resultados indican una reducción de la riqueza (CHAO1 p=0,007), de la diversidad α (Índice de Shannon-Wiener normalizado p=0,0009) y un aumento de la expansión clonal (DE50 p=0,0009) y de clones hiperexpandidos (p=0.0002) de los repertorios de TCR en pacientes COVID-19 graves menores de 55 años. Estos valores fueron similares a los observados en pacientes mayores de 55 años. Además, se observó una disminución en el uso de determinados alelos V a partir de su frecuencia, como TRBV14, en relación tanto con la gravedad (p=0,041) como con la edad (p=0,029), ya que los pacientes graves menores de 55 años mostraron un patrón de uso alélico comparable al de los mayores de 55 años. 

Estos hallazgos sugieren que los pacientes graves menores de 55 años pueden tener un repertorio TCR más deteriorado, lo que conduce a un peor resultado de la enfermedad, con características más propias de los pacientes mayores de 55 años tanto graves como leves.