Muchos síndromes genéticos presentan manifestaciones ecográficas durante el periodo gestacional, sin embargo, esos hallazgos pueden ser limitados y poco específicos ya que pueden ser indicativos de una gran cantidad de síndromes o enfermedades con una clínica y origen genético muy diferente.

En el presente caso clínico, se describe el estudio WES de un feto de 19+6 de edad gestacional con pliegue nucal aumentado y efusión pleural detectados ecográficamente tras un NIPT previo con resultado normal.

El WES se realizó a partir de ADN extraído de muestra de líquido amniótico. Las librerías genómicas fueron generadas con el kit S2/S4 (Ilumina^TM) y secuenciadas en NovaSeq 6000 Sequencing System (Ilumina^TM). Los datos de secuenciación fueron procesados por un algoritmo bioinformático y se analizaron los genes implicados en la ontología genética relacionados con Fetal nuchal edema (HP:0034250), Increased nuchal translucency (HP:0010880) y Pleural effusion (HP:0002202) (The HumanPhenotype Ontology (HPO)). Las variantes se clasificaron de acuerdo con las recomendaciones del American College of Medical Genetics (ACMG) y la European Society of Human Genetics (ESHG).

Se identificaron dos variantes relacionadas con los hallazgos ecográficos. La variante patogénica NM_002834.3:c.317A>C; p.(Asp106Ala) en el gen PTPN11 asociada al Síndrome de Noonan 1 y la variante probablemente patogénica NM_004444.4:c.125G>A; p.(Trp42*) en el gen EPHB4 asociada Malformación linfática 7, ambas con patrón de herencia AD.

Estos resultados ponen en relieve la relevancia de tecnologías genómicas actuales como el WES en estudios prenatales en gestaciones con hallazgos ecográficos anormales y compatibles con síndromes no detectables mediante otras tecnologías más extendidas en el ámbito prenatal, como cariotipo, NIPT o microarrays. También muestra la existencia de un amplio espectro de síndromes con fenotipos muy diferentes y complejos después del nacimiento que pueden cursar con un cuadro de hallazgos ecográficos similar.