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| 01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.: |
Se estima que la tasa diagnóstica de las enfermedades musculares tras estudio de panel de genes o exoma es de alrededor del 50%. En este estudio, se evalúa la utilidad de la secuenciación total del RNA (RNAseq) obtenido a partir de biopsia muscular como herramienta diagnóstica en los casos sin diagnóstico genético tras haber realizado un estudio en ADN genómico. |
| 02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados: |
Se ha secuenciado el RNA total extraído de biopsia muscular de 29 pacientes sin diagnóstico tras exoma o panel de genes, de 5 controles positivos (5 pacientes con una alteración en RNA previamente identificada en el gen DMD) y de 5 controles sanos. Se evaluó la presencia de splicing aberrante (FRASER, LeafCutterMD, rMATS), outliers de expresión (OUTRIDER) y expresión monoalélica en genes de herencia autosómica recesiva. Adicionalmente, se realizó un variant calling a partir de los datos de RNAseq. |
| 03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos: |
Se detectó la presencia de alteraciones patogénicas a nivel de RNA en 6/29 pacientes. Se detectaron dos eventos de exon skipping, un caso de retención intrónica, un evento de splicing alternativo producido por una variante sinónima y dos casos de expresión monoalélica en genes con herencia autosómica recesiva. |
| 04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos: |
El análisis del transcriptoma permite aumentar la tasa diagnóstica en pacientes con enfermedades musculares tras estudios de exoma o panel de genes no concluyentes. Con este estudio piloto se ejemplifica la utilidad del RNAseq como herramienta diagnóstica, siendo particularmente útil en aquellos casos en los que la sospecha clínica está dirigida a un gen o grupo reducido de genes. |
