AEGH2023

RENDIMIENTO DIAGNÓSTICO (RD) GENÉTICO MEDIANTE LA SECUENCIACIÓN COMPLETA DEL EXOMA (WES): ENFOQUE SOLO VERSUS TRIO EN PACIENTES CON TRASTORNOS NEUROPEDIÁTRICOS (TN). Back
Poster Nº: P0156
Autores: Gemma Cartagena Benitez; Iryna Boyko; Claudia Abellán; María Berbel; Carmen Fernández Vizcaino; Marina Martínez Matilla; Daniel Sánchez Valero; Alba Velo; Alberto Fernández-jaén; Sandra García Herrero
Area: 5. Dismorfología y trastornos del neurodesarrollo
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

Los TN son un grupo heterogéneo de enfermedades de complicado diagnóstico. El WES mediante NGS es una herramienta coste-eficiente para el diagnóstico de enfermedades genéticas complejas. En este trabajo retrospectivo comparamos el RD (tasa de resultados concluyentes) de WES en una cohorte de 60 pacientes con TN: 30 casos con enfoque a WES SOLO (estudio del probando) vs 30 casos con enfoque a WES TRIO (estudio del probando y sus progenitores).

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

El WES se realizó a partir de ADN del paciente. Las librerías genómicas fueron generadas con el kit S2/S4 (IlluminaTM) y secuenciadas en NovaSeq 6000 Sequencing System (IlluminaTM). Los datos de secuenciación fueron procesados por un algoritmo bioinformático. Se seleccionaron los genes relacionados con la indicación clínica del paciente basándose en los términos HPO (Human Phenotype Ontology) y se analizaron las variantes de acuerdo con las recomendaciones del American College of Medical Genetics (ACMG) y la European Society of Human Genetics (ESHG).

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

Se establecieron tres tipos de resultados: negativo en los casos en los que no se detectan variantes compatibles con la indicación clínica del paciente, positivo si se detecta(n) variante(s) compatible(s) con la indicación clínica siendo patogénica(s) o probablemente patogénica(s) y no concluyente si la(s) variante(s) detectada(s) es/son de significado incierto. La tasa de resultados no concluyentes es de 56.7% en SOLO vs 16.7% en TRIO, mientras que la de resultados concluyentes (positivos y negativos) es de 43.3% en SOLO vs 83.3% en TRIO.

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

Este estudio presenta una mayor tasa total de resultados concluyentes en el diagnóstico genético de casos de TN mediante un abordaje de TRIO frente a SOLO, cuya tasa de no concluyentes es significativamente superior, probablemente debido a la falta de información de la herencia. Por lo tanto, el WES TRIO podría considerarse la aproximación con mayor RD para enfermedades complejas como los TN.