AEGH2023

INTEGRACIÓN DE DATOS MULTI-ÓMICOS PARA EL DIAGNÓSTICO DE PATOLOGÍAS DEL ESPECTRO RETT Back
Poster Nº: C0168
Autores: Clara Xiol Viñas; Guerau Fernández Isern; Roger Prats Oliva; Núria Brandi Tarrau; María Heredia Torrejón; Gonzalo Villanueva Martín; Paola Pacheco Fernández; Carlota Ros Bonaventura; Maria Del Mar O'callaghan Gordo; ángeles García Cazorla; Laura Martí Sánchez; Dèlia Yubero Siles; Mercè Pineda Marfa; Alfonso Oyarzábal Sanz; Judith Armstrong Morón
Area: 5. Dismorfología y trastornos del neurodesarrollo
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

El síndrome de Rett (RTT) es un trastorno del neurodesarrollo causado generalmente por mutaciones en el gen MECP2. Desde la generalización del uso de la secuenciación masiva se han identificado progresivamente mutaciones en otros genes en pacientes con sospecha de RTT. En este estudio se han analizado los resultados de diferentes pruebas genómicas y se ha implementado una aproximación multi-ómica integrando datos de transcriptómica y proteómica para maximizar el rendimiento diagnóstico.
02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

Se reclutaron 81 pacientes que cumplieran criterios clínicos de RTT sin variantes patogénicas identificadas en MECP2, CDKL5 y FOXG1, y se estudiaron secuencialmente mediante secuenciación del exoma clínico (CES), secuenciación del exoma completo (WES) y secuenciación del genoma completo (WGS) combinada con análisis de expresión génica mediante RNAseq y proteómica en fibroblastos.
03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

En 39 pacientes (48%) se identificaron variantes patogénicas o probablemente patogénicas en genes causantes de patologías del espectro RTT, y en 17 (20%), variantes de significado incierto candidatas a futuros estudios. Un 24% de los diagnósticos se obtuvieron mediante CES, un 20% mediante WES, y un 4% adicional al implementar la aproximación multi-ómica. Las variantes reportadas se encuentran en 44 genes distintos, de los cuales únicamente SYNGAP1, TCF4, SHANK3 y DNMT3A se han identificado como causales en más de un paciente. Gracias a la mejora en la cobertura introducida por la WGS se han podido detectar variantes previamente no identificadas, y los datos de transcriptómica han permitido interpretar biológicamente y reclasificar variantes identificadas mediante WGS, incrementando el rendimiento diagnóstico.
04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

Los trastornos del espectro RTT son patologías con fenotipos solapantes y etiologías genéticas heterogéneas, por lo que requieren del uso de pruebas genéticas con mayor cobertura genómica para un diagnóstico eficaz. Una aproximación multi-ómica integrada aumenta el rendimiento diagnóstico facilitando el proceso de priorización e interpretación de variantes.