La fibrosis quística (CF, del inglés cystic fibrosis; OMIM, 219700) es una enfermedad autosómica recesiva causada por la presencia de variantes homocigotas o heterocigotas compuestas en el gen CFTR. Son más de 2000 las variantes descritas en este geny más de 700 las consideradas como causantes de CF y relacionadas con la respuesta a fármacos, por lo que resulta esencial el empleo de técnicas basadas en secuenciación masiva para el correcto diagnóstico de los pacientes.

En este trabajo se presenta la evaluación analítica de un ensayo de fácil ejecución para la detección de variantes causantes de CF a partir muestras de sangre y/o saliva mediante secuenciación masiva.

VIASURE Cystic Fibrosis NGS Amplicon Library Preparation Kitpermite la preparación de librerías mediante un protocolo basado en dos PCR consecutivas y dos etapas de purificación. Se ha optimizado para la detección simultánea de 712 variantes “causantes de CF” según la actualización “CFTR2_7April2023” de www.cftr2.org, así como aquellas clasificadas como “variantes condicionales de respuesta a fármaco” según PharmKGB, el genotipado de “polyTG/T” y la caracterización de las variantes benignas I506V, I507V y F508C.

Los archivos generados se analizan mediante un flujo optimizado de herramientas bioinformáticas que permite una visualización sencilla de los resultados y facilita el diagnóstico final.

Se han analizado 57 muestras clínicas y sintéticas para cubrir un total de 170 variantes diana, además de 5 muestras wild type, obteniéndose un resultado del 100% de acuerdo global en el test respecto al de referencia para todas las posiciones y tipos de muestra, así como en los ensayos de reproducibilidad y repetibilidad.

Los resultados obtenidos ponen de manifiesto la excelencia analítica del ensayo, convirtiéndolo en un método fiable para la detección de las variantes genéticas relacionadas con fibrosis quística mediante NGS.