Una proporción importante de las personas con enfermedades raras (EERR) no disponen de diagnóstico genético tras la realización de estudios genómicos. El reanálisis de los datos genómicos ha demostrado ser un abordaje útil para aumentar el rendimiento diagnóstico en estos casos.Presentamos los resultados del reanálisis de los datos genómicos de pacientes seleccionados para participar en el programa de EERR de IMPaCT-GENóMICA en la Comunidad de Madrid (CAM), cuya red está configurada por 10 hospitales.

Investigadores e investigadoras de esta red seleccionaron un total de 285 pacientes con diagnóstico presuntivo de enfermedad rara, monogénica, sin diagnóstico genético para participar en el programa. Todos ellos tenían un estudio de exoma completo previo con resultado no concluyente. Aquellos con estudio de exoma realizado en 2020 o con anterioridad fueron considerados para reanálisis de los datos de secuenciación.

En total fueron reanalizados los datos de secuenciación del exoma de 215 pacientes (75%; n=215/285).

Se obtuvo un diagnóstico concluyente en el 12% de los casos reanalizados (n=27/215).

Entre las causas que no permitieron llegar al diagnóstico en el estudio inicial destacan la no asociación gen-enfermedad en el momento del primer estudio, o la aplicación de paneles virtuales que no incluían al gen causal (66,7%; n=18/27), la pérdida de la variante causal en el análisis primario o secundario de los datos (18,5%; n=5/27) y diferencias entre el fenotipo del paciente y el de los casos publicados (14,8%; n=4/27), dificultando establecer una relación de causalidad entre la variante candidata y el fenotipo.

En 23% de los casos, la variante identificada en el reanálisis había sido clasificada como variante patogénica o probablemente patogénica en Clinvar/HGMD.

El reanálisis de los datos genómicos permite mejorar el rendimiento diagnóstico.

El proceso diagnóstico debe considerar el reanálisis y la necesidad continua de evaluación clínica.