La respuesta inmune innata resulta esencial en la primoinfección por SARS-COV-2. Se han descrito variantes patogénicas en genes de respuesta de interferones tipo I como causantes de susceptibilidad a COVID-19 grave. Nuestro objetivo es estudiar la susceptibilidad genética del huésped a padecer COVID-19 grave.

Estudio de casos y controles incluyendo pacientes ≥18 años con COVID-19 previa a la vacunación. Los casos son pacientes con una puntuación de gravedad en la escala ordinal de la OMS ≥4 y los controles presentan una puntuación ≤2. Se secuenciaron 363 personas (280 casos; 83 controles) mediante un panel de 136 genes seleccionados a partir de revisión bibliográfica, se utilizaron librerías KAPA HyperCap y secuenciación NextSeq™ 550Dx-Illumina. Se priorizó el análisis de variantes en los 17 genes más relacionados: TLR7, IFR7, IFNAR1, IFNAR2, TLR3, TICAM1, TBK1, IRF3, UNC93B1, TYK2, MYD88, IRAK4, IRF9, TRAF3, IKBKG, STAT1, STAT2.

Se encontraron 82 variantes raras (frecuencia alélica menor <0.01) en TLR7, IFNAR1, IFNAR2, IRAK4, IRF3, IRF7, IRF9, MYD88, STAT1, STAT2, TBK1, TICAM1, TLR3, TRAF3 y TYK2 en 101 pacientes, siendo más probable hallar una variante rara en casos (OR=2.22; IC 95% 1.18-4.16; p=0.0127). Se identificaron un total de 7 variantes raras truncantes en IFNAR1, IRF7, IRF9, TLR3 y TYK2, seis de ellas en casos. Además, se identificó la variante p.Ser186Leu en TICAM1, descrita previamente como patogénica. De interés una variante no descrita en la literatura en TLR7, p.His90Tyr, en una paciente.

Los genes TLR7, IFNAR1, IFNAR2, IRAK4, IRF3, IRF7, IRF9, MYD88, STAT1, STAT2, TBK1, TICAM1, TLR3, TRAF3 y TYK2 se encuentran implicados en la susceptibilidad genética a la COVID-19 grave. Es posible encontrar variantes raras de pérdida de función en pacientes con COVID-19 grave. Es necesario profundizar en el estudio funcional y de segregación de las variantes para poder obtener resultados más concluyentes.