La secuenciación del exoma completo (WES) es una herramienta diagnóstica utilizada en nuestro centro para el abordaje diagnóstico de una amplia diversidad de enfermedades con una elevada heterogeneidad genética. El objetivo es valorar nuestro rendimiento diagnóstico tras la realización del WES, estudios funcionales y estudios de ampliación.

Desde 2019 se ha secuenciado el exoma de 1123 pacientes y se han analizado los genes relacionados con el fenotipo mediante el uso de paneles virtuales y/o utilizando los términos HPO. Además en 22 pacientes se ha realizado un segundo estudio ampliando el número de genes inicialmente analizados. Por último, se han realizado estudios funcionales en 3 variantes localizadas en posiciones no canónicas de splicing en los genes WDR45, SPAST y BMPR2.

El rendimiento diagnóstico de la secuenciación masiva es del 30% (331/1123). Este porcentaje oscila de 10% a 80% en función de la patología a estudio. En un 18% de los casos (202/1123) se han detectado variantes de significado clínico incierto. El pipeline de análisis utilizado permite la detección de variantes puntuales, algunas de ellas de hasta 85bp, así como de variantes del número de copia (CNVs). El estudio del ARNm ha permitido reclasificar 3 variantes como probablemente patogénicas tras demostrar la alteración del splicing. Los estudios de ampliación han permitido diagnosticar un 23% (5/22) de los pacientes estudiados.

Se han identificado variantes candidatas en aproximadamente el 50% de los casos estudiados (533/1123). Los nuevos pipeline de análisis permiten la detección de variantes puntuales y CNVs de manera robusta, por lo que es recomendable revisar los protocolos de estudio actuales para incorporar el uso del WES como first-tier test en el diagnóstico de enfermedades genéticas. Realizar estudios de ampliación en pacientes con fenotipos complejos puede incrementar el diagnóstico.