AEGH2023

HALLAZGOS SECUNDARIOS EN LA POBLACIÓN ESPAÑOLA: UN ANÁLISIS EXHAUSTIVO UTILIZANDO LA BASE DE DATOS CSVS. Back
Poster Nº: P0221
Autores: Noemí Toro Barrios; Rosario Carmona Muñoz; Virginia Aquino Quintans; Javier Pérez Florido; Gema Roldán González; Carlos Loucera Muñecas; José Luis Fernández Rueda; Gerrit Bostlemann; Daniel López López; Francisco Manuel Ortuño Guzmán; Beatriz Morte Molina; María Peña Chilet; Joaquín Dopazo Blázquez
Area: 13. Bioinformática Clínica
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

La rápida evolución y el abaratamiento de las nuevas tecnologías de secuenciación han permitido su implantación en la práctica clínica para el diagnóstico. Además de este diagnóstico primario, el análisis de exomas y genomas permite la búsqueda de variantes genéticas no relacionadas con el diagnóstico primario, pero que pueden tener consecuencias para la salud. Son los denominados hallazgos secundarios (SF). El Colegio Americano de Medicina Genética (ACMG) publica periódicamente guías de recomendaciones y listas de genes accionables para la detección de estos hallazgos.

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

La base de datos de frecuencia de variantes de población española CSVS ha sido analizada según los criterios de ACMG (en su versión 3.1) para la determinación de la tasa de SF, buscando variantes patogénicas o probablemente patogénicas en estos genes de acuerdo a la base de datos ClinVar, y/o su clasificación ACMG determinada con la herramienta InterVar.

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

Se han identificado 60 variantes patógenicas o probablemente patogénicas reportables como SF en 57 de 1129 muestras individuales de CSVS, lo que representa una prevalencia de hallazgo secundario del 5% en nuestra cohorte. Estas variantes afectan a 32 de los 78 genes propuestos por el ACMG: 19 relacionados con enfermedades cardiovasculares (59,4%, la categoría fenotípica más prevalente), 8 (25%) con síndromes oncológicos, 2 (6,3%) con errores congénitos del metabolismo y 3 (9,4%) a fenotipos diversos (hipertermia maligna y hemocromatosis hereditaria).

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

La utilización de bases de datos poblacionales dinámicas como CSVS para el análisis de SF minimiza posibles sesgos y permite el reanálisis periódico a medida que crece la población, aumenta el número de variantes patogénicas conocidas o cambian las recomendaciones de ACMG.

Los resultados de este estudio informan sobre la prevalencia de las variantes patogénicas o probablemente patogénicas en la población española y amplían el conocimiento existente sobre los SF en esta población.