Las enfermedades mitocondriales están causadas por defectos en el ADN mitocondrial (ADNmt) o en genes nucleares implicados en el funcionamiento de las mitocondrias. Las mutaciones del ADNmt pueden presentar una heteroplasmia variable según el tejido y ser indetectables en sangre, lo que complica el diagnóstico molecular. Se describe el caso de una paciente de 68 años que presentaba ptosis bilateral, oftalmoplejía, debilidad muscular proximal y fibras rojo rasgadas COX-negativas en la biopsia muscular.

Ante la sospecha clínica de oftalmoplejía externa progresiva crónica (CPEO), cuya causa suelen ser deleciones esporádicas del ADNmt que sólo se detectan en músculo esquelético, se decidió analizar el exoma completo (WES) y el ADNmt de un tejido afectado. A partir de ADN extraído de una biopsia muscular (deltoides), se preparó una librería NGS mediante enriquecimiento por hibridación con el kit KAPA HyperExome (Roche), al que se añadieron sondas KAPA HyperChoice (Roche) para el ADNmt, y se secuenció con la plataforma Illumina NovaSeq 6000 S4 (CNAG). El análisis bioinformático se realizó con Varsome Clinical. Las lecturas del ADNmt se compararon con un control en el visualitzador IGV para detectar deleciones y calcular la heteroplasmia. Se realizó una PCR específica para confirmar la deleción identificada y los puntos de corte.

Mediante NGS se detectó una deleción de 6372 pb en el ADNmt, en un  17% de heteroplasmia en el músculo estudiado, con puntos de corte situados en los genes COX1 y ND5 (m.6958_13329del). La alteración no se detectó en sangre periférica, lo que indicó que estaba confinada al músculo esquelético y que el riesgo de transmisión a la descendencia era muy bajo.

El análisis del ADNmt de tejido afectado mediante NGS permite detectar tanto mutaciones puntuales como deleciones y mejora el rendimiento diagnóstico de las enfermedades mitocondriales que se encuentran en heteroplasmia.