AEGH2023

USO DE LA PLATAFORMA COLABORATIVA GENEMATCHER EN EL DESCUBRIMIENTO DE NUEVOS GENES ASOCIADOS A ENFERMEDADES RARAS Back
Poster Nº: C0271
Autores: Nuria Martinez Gil; Irene Valenzuela; Amaia Lasa-aranzasti; Anna Maria Cueto; Mar Costa-roger; Marta Codina-solà; Berta Campos; Paula Fernández-álvarez; Alejandro Moles-fernández; Laura Trujillano; Barbara Masotto; Jordi Leno-colorado; Eduardo Tizzano; Elena García-arumí
Area: 12. Nuevas aproximaciones y tecnologías diagnósticas
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

A pesar del evidente éxito que ha supuesto la secuenciación del exoma completo (WES) en la práctica clínica, más de la mitad de los casos permanecen sin diagnosticar. En parte es debido, a que las enfermedades estudiadas presentan una incidencia muy baja, lo que dificulta reunir suficientes pacientes con variantes en el mismo gen. Por lo tanto, son necesarios esfuerzos colaborativos entre investigadores para compartir datos clínicos y genéticos, que pueden ser mediados a través de plataformas como GeneMatcher.

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

Un equipo multidisciplinar seleccionó variantes en genes no asociados previamente a enfermedad, en WES no concluyentes de pacientes con enfermedades raras durante el periodo de un año.  La priorización se hizo en base a la posible patogenicidad de la variante (predictores in silico, frecuencia poblacional, etc) y función del gen (Pubmed, constraint metrics, etc). Una vez seleccionadas, se compartió la información del fenotipo asociado a través de la plataforma GeneMatcher.

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

De los 212 casos introducidos en la plataforma se seleccionaron un total de 654 genes, lo que resultó en más de 5000 matches (7,8 matches/gen), para los que únicamente se obtuvo respuesta en el 25% de los casos. A través del intercambio de información hubo coincidencias fenotípicas con 138 genes para los que se comprobó el patrón de herencia en la familia. Entre estos, 23 variantes cosegregaban con el fenotipo. Para la mayoría de estos casos, se han iniciado estudios funcionales y en uno de los casos ha llevado al diagnóstico genético del paciente y la publicación de la descripción del gen RAB34 asociado a un nuevo síndrome oro-facio-digital (PMID: 37384395). 

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

El uso de plataformas colaborativas como GeneMatcher permite descubrir nuevos genes, llegando al diagnóstico genético, así como identificar posibles nuevas dianas terapéuticas que resulten en nuevos fármacos específicos para la enfermedad.