El 80% de las enfermedades raras tienen un componente genético, por lo que la genómica y la secuenciación de nueva generación (NGS) están permitiendo impulsar su investigación y el manejo clínico de las familias afectas; sin embargo, su implementación clínica presenta aún algunas limitaciones. Nuestro objetivo ha sido desarrollar una estrategia personalizada basada en NGS para la incorporación de la medicina de precisión en un sistema público de salud.

Se diseñaron y aplicaron tres versiones consecutivas de un panel personalizado de hasta 1397 genes en 6257 pacientes índices, utilizando la plataforma NextSeq500 de Illumina. Para su implementación, se definieron hasta 886 paneles virtuales y se desarrolló una herramienta bioinformática corporativa (MMP). Además, se realizaron estudios familiares en los casos con variantes probablemente patogénicas.

La validación de esta estrategia mostró una tasa de detección de mutaciones >95% y altos valores de calidad tanto de la secuenciación como del análisis secundario y terciario de los datos mediante MMP. Su aplicación permitió identificar una posible causa genética de la enfermedad en 2058 casos, obteniendo tasas diagnósticas entre el 9-62% para los principales grupos de enfermedades, un rendimiento global del 32.9%, y un diagnóstico parcial en el 6,4% de los pacientes. Además, los estudios de segregación permitieron derivar aún más pacientes a ensayos clínicos, programas de diagnóstico preimplantacional y tratamientos farmacológicos o quirúrgicos específicos.

Esta aproximación, junto a un sistema de salud universal, ha permitido mejorar la eficiencia del diagnóstico genético y desarrollar una solución corporativa que propicia un entorno de trabajo controlado, seguro y adaptado a las necesidades de nuestro centro, profesionales y pacientes. Además, la integración de la información clínica y genómica ha abierto un amplio abanico de posibilidades tanto para los estudios retrospectivos como prospectivos en el ámbito sanitario, repercutiendo en un beneficio clínico relevante para los pacientes.