Las anomalías congénitas afectan aproximadamente a un 2-3% de los nacimientos y son debidas principalmente a desordenes genéticos. Actualmente, la implementación de la secuenciación de exoma basado en trio para el diagnóstico genético prenatal está en sus inicios, presentando rendimientos diagnósticos muy variables entre hospitales.

El propósito del estudio es evaluar el rendimiento diagnóstico del diagnóstico prenatal mediante el análisis de exoma basado en tríos.

En la Unidad, desde 2019 a 2023, y  tras el asesoramiento genético y aceptación del consentimiento informado, se han secuenciado 149 estudios prenatales con anomalías ecográficas, con resultado normal en QF-PCR y array-CGH. Se ha secuenciado el exoma (Illumina) de muestras de ADN fetal, junto con las de sus progenitores. Fueron reportadas aquellas variantes clasificadas según criterios de ACMG en genes relacionados directamente con la anomalía ecográfica. Para este estudio, agrupamos los resultados en patogénicos, de significado incierto (VUS) y no informativos. 

El 31% (n=46) de los estudios obtuvo un resultado patogénico y un 3% (n=4) VUS siendo el resto no informativos. Los resultado patogénicos incluyen variantes clasificadas como patogénicas y probablemente patogénicas siendo en un 54% de origen de novo y en un 33% autosómico recesivas.

 Por anomalía ecográfica, las alteraciones esqueléticas son las que presentan un mayor rendimiento. El 40% (14/35) de los informes obtuvieron resultado patogénico. Las anomalías del sistema nervioso central presentaron un informe patogénico en el 31% (9/29) de los casos.  Resultados similares se observaron en casos de crecimiento intrauterino retardado e hidropesía fetal 35% (14/40). Las afectaciones cardiovasculares fueron las de menor rendimiento al obtener un resultado patogénico en el 16% de los estudios (4/25).

La secuenciación del exoma trío es útil para el diagnóstico prenatal. Su implementación requiere de guías específicas y la existencia de bases de datos de genes y sus variantes ligados a fenotipos ecográficos prenatales.