Mutaciones heterocigotas deletéreas en los genes PKD1 y PKD2 son responsables del desarrollo de poliquistosis renal autosómica dominante tipo 1 (PQRAD-1) y 2 (PQRAD-2). PKD1 y PKD2 son genes de pérdida de función, las variantes de tipo truncantes (frameshift, nonsense, splicing) son generalmente causales de enfermedad, pero resulta difícil asignar la patogenicidad en variantes  no-truncantes (missense, in-frame) cuando no hay información en la literatura científica ni estudios funcionales.

Se analizaron los resultados genéticos realizados mediante una librería de captura para NGS a una cohorte de 205 pacientes con sospecha de PQR. El estudio se complementó con el análisis de amplicones de la región pseudogénica de PKD1.

En 147 pacientes se reportaron variantes en los genes PKD1 (114; 43 con variantes truncantes y 71 no-truncantes) y PKD2 (33; 31 truncantes y 2 no-truncantes). Se identificaron 47 variantes no-truncantes en PKD1, 7 clasificadas como patogénicas/probablemente patogénicas y 40 como variantes de significado incierto (VUS), identificadas en un caso índice en el count de nuestra base de datos interna, menos 10 que se identifican en más de 1. Destacamos tres variantes de tipo missense, no caracterizadas, 2 de ellas reportadas en bases de datos, cuya patogenicidad fue reevaluada de acuerdo a nuestra base de datos interna. Con esta información y en base a los estándares de clasificación ACMG, podemos reclasificar las variantes a posiblemente patogénicas considerando los criterios PS4 y PM2.

En PKD2 se han identificado sólo 2 variantes VUS, ambas en un único probando (el resto son de truncamiento).

Un count interno para contabilizar el número de casos índice en los que una variante está presente se propone como una ventaja para reclasificar las variantes VUS para las que no haya información en la literatura científica ni estudios funcionales disponibles, pudiendo aplicar el criterio PS4 de ACMG, complementado con estudios de cosegregación familiar.