En la era genómica, analizar el efecto clínico de las variantes identificadas en los análisis genómicos es un desafío en la práctica clínica. Las pruebas funcionales son una forma poderosa de demostrar la patogenicidad de tales variantes genéticas y, los laboratorios de genómica funcional son un complemento importante para los laboratorios de genética. En este contexto surge el proyecto RareFunction asociado a un grupo de trabajo del programa IMPaCT-GENóMICA y de una acción estratégica del CIBERER, cuyo objetivo principal es poder dar respuesta clínica mediante la implementación de la una red nacional de genómica funcional.

Se estructura en una Red de grupos de investigación clínica, coordinados por un grupo core de expertos que evalúa las variantes utilizando herramientas computacionales y la clínica y propone acciones de genómica funcional de respuesta rápida en combinación con aproximaciones de análisis multiómicos en muestras biológicas y la generación de modelos celulares.

Se han definido y establecido protocolos de actuación y procedimientos y se han recogido una batería de pruebas in silico y ensayos funcionales ex vivo/in vivo. Se ha realizado un pilotaje evaluando e iniciando estudios funcionales de las variantes identificadas en estudios de exoma en 11 casos del programa IMPaCT-GENóMICA y 12 de programa ENoD del CIBERER, referidos desde 12 hospitales. Además de los ensayos iniciados, en varios casos la evaluación ha permitido descartar la variante candidata y sugerir la continuidad con estudios genómicos alternativos.

1) En la evaluación de los casos es importante tener una buena caracterización clínica fenotípica de los pacientes y familiares. 2) Se necesita equipos multidisciplinares para la evaluación y resolución de las variantes a estudio. 3) RareFunction es una estructura federada de genómica funcional con garantías de implementación en el SNS para mejorar el diagnóstico de las enfermedades raras.