La leucemia aguda (LA) es la neoplasia más frecuente en edad pediátrica. Aunque su etiología es en gran parte desconocida, en los últimos años se han descrito factores genéticos que favorecen su desarrollo en un 4-5% de los pacientes conocidos como síndromes de predisposición a cáncer infantil (SPCi). La identificación de un SPCi es clave para el correcto manejo y seguimiento de los pacientes, sin embargo, la mayoría no presentan antecedentes familiares y son infradiagnosticados. En este estudio llevamos a cabo un análisis genético retrospectivo de pacientes pediátricos diagnosticados de leucemia linfoblástica aguda (LLA) con el fin de mejorar el diagnóstico y manejo de pacientes con SPCi.

Se llevó a cabo el estudio genético de 315 pacientes de LLA sin antecedentes familiares, empleando la plataforma Illumina y un panel de NGS propio (mut4Child), que incluía 352 genes asociados a SPCi. El análisis bioinformático, clasificación e interpretación de las variantes tipo SNV, indel y CNV se realizó utilizando una pipeline de diseño propio, la herramienta VarSeq v2.2.5 (Golden Helix) y siguiendo las guías de la AMP.

Se detectaron 14 variantes germinales clasificadas como patogénicas o probablemente patogénicas y se diagnosticaron un total de 9 pacientes con SPCi (3.4%). 51 pacientes fueron excluidos por presentar enfermedad mínima residual. Los genes más frecuentemente alterados que conferían un riesgo aumentado a desarrollar LLA pediátrica fueron: PAX5(n=1), TP53(n=2), BRCA2(n=1), BRCA1(n=1) y FANCA(n=1). Gracias a su identificación muchos de los pacientes pudieron recibir asesoramiento genético y un seguimiento individualizado en base a su diagnóstico genético.

Los resultados obtenidos demuestran que la implementación de paneles de NGS y pipeline bioinformáticas customizados para la optimización diagnóstica de los SPCi asociados a LLA es viable y pone de manifiesto la relevancia en el manejo clínico y seguimiento de los pacientes y familiares.