AEGH2023

RECLASIFICACIÓN DE VARIANTE EN VPS33B EN HOMOCIGOSIS, ASOCIADA A FENOTIPO LEVE DEL SÍNDROME ARC Back
Poster Nº: P0388
Autores: Fuensanta Gomez Bernal; Rodrigo Del Brio Castillo; Antonia Pérez Cejas; Ana Alonso Larruga; Felícitas Díaz-flores Estévez; Agustín Francisco González Rivero; Yolanda Fernández Cladera
Area: 4. Enfermedades metabólicas y mitocondriales
 
01. Introducción y Objetivos: Breve introducción indicando el propósito del estudio.:

Niña de 10 años condiscapacidad intelectual leve, disgenesia del cuerpo calloso e hipoplasia del esplenio, hipoacusia neurosensorial moderada, hipertransaminasemia leve y fosfatasa alcalina elevada desde el primer año de vida, con GGT y bilirrubina normales. Se descartaron múltiples causas de enfermedad hepática. Ecografía hepática-biliar normal. La paciente presentaba prurito crónico que hasta 2021 no se atribuyó a colestasis tras remitir con ácido ursodesoxicólico.

02. Métodos: Descripción concisa de los métodos utilizados:

En 2020, se realizó un panel de genes asociados a síndromes con disfunción intestinal, hepática y/o pancreática.

03. Resultados: Resumen de los resultados obtenidos:

Se identificó la variante c.1148T>A;p.Ile383Asn en el gen VPS33B en HOMOCIGOSIS. Dicha variante no se encontraba en bases de datos de población, ni en bases de datos clínicas ni en literatura científica hasta esa fecha. Puesto que la paciente no presentaba los signos cardinales típicos del síndrome ARC (artrogriposis, disfunción renal y colestasis), se clasificó como variante de significado incierto.

En 2022, Linhares y colaboradores publican 3 pacientes con esta misma variante (dos hermanos en homocigosis y otro en heterocigosis compuesta con una variante de splicing), y un fenotipo atenuado del síndrome ARC, sin artrogriposis ni daño renal con colestasis GGT-normal. Ante esta nueva evidencia comprobamos que el fenotipo de nuestra paciente se correspondía con los descritos por Linhares (retraso del neurodesarrollo, agenesia del cuerpo calloso, hipoacusia y colestasis GGT-normal), reclasificándose la variante como PROBABLEMENTE PATOGÉNICA.

04. Conclusiones: Basadas en los resultados obtenidos:

Gracias a esta publicación pudimos ofrecer un diagnóstico clínico y genético a nuestra paciente.

El uso habitual de exomas identifica variantes genéticas de significado inciertoque, incluso estando en homocigosis o heterocigosis compuesta en genes de herencia autosómica recesiva, no permite concluir un resultado genético positivo si no existe una clara asociación genotipo-fenotipo, como ha ocurrido en este caso. Consideramos que este uso ampliado de exomas debería estar acompañado de plataformas libres que permitan compartir variantes encontradas y sus fenotipos asociados, minimizando así los diagnósticos genéticos inciertos.