La implementación de la farmacogenetica (PGx) en la clínica está resultando lenta y complicada debido a la falta de tecnologías adecuadas dentro del ámbito hospitalario, así como a la dificultad asociada a la interpretación de los resultados. En el presente proyecto, hemos desarrollado y validado técnicamente una solución diagnóstica que permite la generación de un informe PGx con recomendaciones terapéuticas para 59 fármacos. Además, se ha realizado una validación clínica a través de un estudio piloto multicéntrico.

Para el análisis genético se ha utilizado un array de genotipado masivo que permite la identificación de más de 44.0000 variantes PGx. El desarrollo de informes farmacogenéticos se ha realizado con una herramienta bioinformática desarrollada in-house. Para la validación de la tecnología, se han incluido 192 muestras control, y para la fase de validación clínica, 347 pacientes procedentes de 3 hospitales de distintas partes de España. 

 Los resultados obtenidos tienen una tasa concordancia >99% de los marcadores con evidencia 1A y una reproducibilidad >99%. La detección de CNVs en CYP2D6 mostró una sensibilidad del 100% y una especificidad del 94.4%

El 97,4% de los 347 pacientes estudiados mostraron alteraciones de la pauta terapéutica en al menos uno de los 17 genes estudiados, presentando una media de alteraciones en 2,6 genes (mín-máx: 0-6). Los principales genes que tenían asociados alteraciones de la pauta terapéutica fueron CYP2C19 (56.4%), IFNL3 (48,7%), CYP2B6 (41,9%), CYP2D6 (40.4%) y CYP2C9 (36.9%). Por último, el uso del genotipado masivo permitió la identificación de alelos que no habían sido detectados previamente permitiendo una mejor caracterización de los individuos.

Los resultados obtenidos demuestran que la solución diagnóstica desarrollada es una herramienta robusta que permite la determinación del perfil PGx completo de los pacientes que puede ser de utilidad para hospitales donde no se dispone de la tecnología necesaria.