Las puntuaciones de riesgo poligénico (PRS) han demostrado su potencial para predecir la probabilidad de desarrollar cáncer. Esto permite estratificar el riesgo y mejorar los programas de cribado. Entre ellos, PRS₃₁₃ para cáncer de mama ha demostrado el mejor rendimiento en mujeres europeas (Mavaddat et al., 2018). Este proyecto pretende aportar la evidencia necesaria para implementar un programa de cribado personalizado de cáncer de mama en Navarra basado en este PRS. Para ello, la validación previa en nuestra población es esencial, por lo que el objetivo consiste en evaluar la aplicabilidad del PRS₃₁₃ en Navarra.

Se evaluó la aplicación del PRS₃₁₃ en 803 muestras de genoma completo de mujeres navarras, estratificándolas en 3 grupos de riesgo: alto, moderado y poblacional. A continuación, se realizó un análisis exploratorio, calculando las tasas de llamada de SNPs y muestras, y la frecuencia de cada SNP en nuestra población. Finalmente, se evaluó la aplicabilidad del PRS mediante métodos descritos previamente para abordar los SNPs faltantes (Collister et al., 2022), y se compararon las medianas de los grupos de riesgo alto y poblacional.

Tras aplicar los criterios de selección, se incluyeron 339 muestras. Cada muestra contenía al menos 274 SNPs disponibles, pero sólo 211 eran evaluables en todas ellas. Se observaron diferencias significativas en las frecuencias alélicas de 27 SNPs (p < 0.05) en comparación con las descritas por Mavaddat. Respecto a los SNPs faltantes, la sustitución por la frecuencia rindió los mejores resultados y permitió seleccionar el modelo que maximizaba la diferencia entre los grupos de riesgo alto y poblacional.

Estos resultados resaltan la necesidad de adaptar y desarrollar un PRS apropiado para nuestra población y los datos disponibles. En definitiva, aplicar PRS descritos en diferentes poblaciones es un desafío y requiere guías estándar para su evaluación y el tratamiento de los datos faltantes.