Las malformaciones vasculares (MVs) engloban un amplio grupo de trastornos del desarrollo del sistema circulatorio. Las MVs pueden ser heredadas o producirse de forma esporádica como consecuencia de alteraciones somáticas. El objetivo es el de la validación y evaluación del rendimiento diagnóstico de un panel de genes en la práctica clínica.

Se incluyeron 32 muestras procedentes pacientes con diagnóstico clínico de MV (8 sangres periféricas y 24 biopsias), en los cuales se realizó secuenciación masiva a alta profundidad de un panel de 95 genes (MiSeq, Illumina, 2x150pb).El análisis bioinformático se realizó con el software SeqOne (GRCh37).Se trata de una de las mayores cohortes descritas hasta la fecha.

Se obtiene una cobertura del 100% de las regiones incluidas en el panel, con un porcentaje de alineamiento superior al 99% y un on-target del 66%. El límite de detección es del 3%.

En el 50% (4/8) de las muestras de sangre se detectaron alteraciones germinales en los genes RASA1, EPHB4 y TEK.

En el 67% (16/24) de las muestras de tejido fresco se detectaron alteraciones somáticas de baja frecuencia alélica (FA) en PIK3CA, TEK, GNAQ, KRAS, MAP2K1 y HRAS (Rango de FA: 3,1% - 12,1%). Además, en una muestra de tejido se detectó una variante en TEK con una FA del 45%, en este caso es necesario analizar otro tipo de tejido para concluir si la variante es de origen germinal o somático. Los genes más frecuentemente mutados fueron TEK y PIK3CA.

La metodología empleada es adecuada para la detección de alteraciones germinales y somáticas en muestras de sangre o de tejido fresco.

Para la detección de las alteraciones somáticas de baja frecuencia alélica es imprescindible la secuenciación masiva a alta profundidad.

Nuestros hallazgos amplían el espectro molecular de las MVs y muestran la relevancia de las pruebas genéticas para el diagnóstico preciso y la selección de las terapias dirigidas.